Description
The Tara Pacific expedition sampled differents ecosystems of the oceans during a two-year expedition (2016-2018), collecting environmental data and surface plankton of Atlantic and Pacific Ocean, from viruses to metazoans, on board the 36-metre Tara Schooner. Surface microplankton were collected using a custom-built water pumping system called the Dolphin, designed for use while sailing at high speed. The pumped water was filtered through a 20 µm mesh net (Deck-Net) installed on the deck of the schooner Tara.
See https://doi.org/10.17882/102697 for more details.
Enregistrements de données
Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 414 enregistrements.
2 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.
Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.
Versions
Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.
Comment citer
Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:
Mériguet Z, Lombard F, Bourdin G, Jalabert L, Bun O, Caray--Counil L, Elineau A, Gorsky G, The Tara Pacific Consortium (2026). Global scale surface meso-plankton dataset collected with Deck Net and imaged with Flowcam during the Tara Pacific Expedition. Version 1.4. EcoTaxa. Samplingevent dataset. https://ipt.data-terra.org/resource?r=tara-pac-flowcam-decknet&v=1.4
Droits
Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:
L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est EcoTaxa. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0.
Enregistrement GBIF
Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : d977ef4a-94ec-4d26-aa9a-ad665907f8fd. EcoTaxa publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du GBIF France.
Mots-clé
Plankton; Imaging; EcoTaxa; DeckNet; Flowcam; Samplingevent
Données externes
Les données de la ressource sont disponibles dans d'autres formats
| Global scale surface micro-plankton dataset collected with Deck Net and imaged with FlowCam during the Tara Pacific Expedition | https://www.seanoe.org/data/00915/102697/ UTF-8 TSV, CSV |
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Contacts
- Fournisseur Des Métadonnées ●
- Créateur ●
- Personne De Contact
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- Créateur
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- Créateur
Couverture géographique
See coordinates
| Enveloppe géographique | Sud Ouest [-35,61, -179,063], Nord Est [45,236, 178,933] |
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Couverture taxonomique
Pas de description disponible
| Kingdom | Animalia, Bacteria |
|---|---|
| Phylum | Annelida, Ciliophora, Cyanobacteria, Foraminifera, Mollusca, Rotifera |
| Subphylum | Crustacea, Tunicata |
| Class | Acantharia, Appendicularia, Bacillariophyceae, Cyanophyceae, Dictyochophyceae, Dinophyceae |
| Subclass | Copepoda, Coscinodiscophycidae |
| Order | Asterolamprales, Gonyaulacales, Gymnodiniales, Nassellaria, Spumellaria, Thalassionematales |
| Suborder | Tintinnina |
| Family | Amphilithidae, Bacillariaceae, Codonellidae, Pyrocystaceae, Rhabdosphaeraceae, Rhizosoleniaceae, Undellidae, Xystonellidae, Zoothamniidae |
| Genus | Amphisolenia, Amphorides, Amplectella, Asterionellopsis, Bacteriastrum, Ceratocorys, Chaetoceros, Cladopyxis, Climacodium, Codonaria, Codonellopsis, Corethron, Cyttarocylis, Dactyliosolen, Dadayiella, Diatoma, Dictyocysta, Dinophysis, Ditylum, Epiplocylis, Eucampia, Eutintinnus, Fragilariopsis, Guinardia, Helicotheca, Hemiaulus, Lacrymaria, Metacylis, Micracanthodinium, Neoceratium, Nitzschia, Ornithocercus, Oxytoxum, Phalacroma, Planktoniella, Podolampas, Poroecus, Protoperidinium, Pseudo-nitzschia, Pterosperma, Pyrophacus, Rhabdonella, Rhabdonellopsis, Richelia, Salpingella, Steenstrupiella |
| Species | Chaetoceros peruvianus, Chaetoceros protuberans, Codonellopsis orthoceras, Coscinodiscus sol, Hemidiscus cuneiformis, Ornithocercus heteroporus, Ornithocercus magnificus, Ornithocercus quadratus, Ornithocercus steinii, Tripos candelabrum, Tripos furca, Tripos fusus, Tripos geniculatus, Tripos limulus, Tripos pentagonus |
Couverture temporelle
| Date de début / Date de fin | 2016-06-10 / 2018-08-31 |
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Métadonnées additionnelles
| Remerciements | Special thanks to the Tara Ocean Foundation, the R/V Tara crew and the Tara Pacific Expedition Participants (https://doi.org/10.5281/zenodo.3777760). We are keen to thank the commitment of the following institutions for their financial and scientific support that made this unique Tara Pacific Expedition possible: CNRS, PSL, CSM, EPHE, Genoscope, CEA, Inserm, Université Côte d’Azur, ANR, agnès b., UNESCO-IOC, the Veolia Foundation, the Prince Albert II de Monaco Foundation, Région Bretagne, Billerudkorsnas, AmerisourceBergen Company, Lorient Agglomération, Oceans by Disney, L’Oréal, Biotherm, France Collectivités, Fonds Français pour l’Environnement Mondial (FFEM), Etienne Bourgois, and the Tara Ocean Foundation teams. Tara Pacific would not exist without the continuous support of the participating institutes. The authors also particularly thank Serge Planes, Denis Allemand, and the Tara Pacific consortium. We thank the EMBRC collection CCPv for sample storage. This work was supported by EMBRC-France, whose French state funds are managed by the ANR within the Investments of the Future program under reference ANR-10-INBS-02. Support was also provided by the US National Science Foundation (NSF Biological Oceanography program (grant #2025402 to LKB) and the NASA Ocean Biology and Biogeochemistry program (grants #80NSSC20K1641). FL was also funded by the Institut Universitaire de France and co-funding by the European Union BIOcean5D GA#101059915 and the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme “Atlantic Ecosystems Assessment, Forecasting and Sustainability” (AtlantECO) Grant ID: 862923. FL, OB, ZM are also funded by the ANR grant SmartBiodiv (grant ANR-21-AAFI-0002). The authors particularly thank the Villefranche-sur-Mer Quantitative Imaging Platform (PIQv). Views and opinions expressed are however those of the author(s) only and do not necessarily reflect those of the European Union. Neither the European Union nor the granting authority can be held responsible for them. |
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| Objet | Surface water samples were collected using a custom-built water pumping system named “Dolphin”. It consists of a stainless-steel pyramidal frame with a front aperture of 0.04 m wide and 0.40 m high, deployed from the starboard of the ship. The Dolphin was used underway while sailing and was connected to a peristaltic pump (max flow rate = 3 m3 h−1) mounted on the deck of the schooner Tara. The system was equipped with a flowmeter to record flow rates. The pumped water was filtered through a 20 μm net (Deck156 Net) that was mounted on the wall of the wet lab. Before entering the Deck-Net, the pumped water passes through a 2000 µm mesh filter. Deck-Net pumping lasted 1 to 2 hours, depending on plankton concentration. Samples were divided into subsamples, which included one subsample for quantitative micro-plankton imaging analysis on live samples and the remaining for other specific protocols. |
| Description de la fréquence de mise à jour | periodic review of origin data |
| Identifiants alternatifs | d977ef4a-94ec-4d26-aa9a-ad665907f8fd |
| https://ipt.data-terra.org/resource?r=tara-pac-flowcam-decknet |