RiOMar SeineMO-2 - Phytoplankton diversity at high spatial and temporal resolution (IFCB)

Événement déchantillonnage
Dernière version Publié par EcoTaxa le août 5, 2026 EcoTaxa
Accueil:
https://ecotaxa.obs-vlfr.fr/api/collections/by_title?q=RiOMar+SeineMO-2+-+Phytoplankton+diversity+at+high+spatial+and+temporal+resolution+%28IFCB%29
Date de publication:
5 août 2026
Publié par:
EcoTaxa
Licence:
CC-BY-NC 4.0

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Données sous forme de fichier DwC-A (zip) télécharger 105 enregistrements dans Anglais (98 KB) - Fréquence de mise à jour: inconnue
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Description

The RiOMar SeineMO-2 oceanographic campaign (17 - 31 July 2024) was coordinated by the Laboratoire d'Océanologie et Géosciences (CNRS UMR 8187 LOG) on the "Côtes de la Manche" R.V. (French Oceanographic Fleet). Phytoplankton was sampled in French waters of the Eastern English Channel. The Imaging FlowCytoBot enabled imaging of nano- and microphytoplankton (10 µm to 150 µm), every 30 minutes from underwater continuous pumping in surface waters (5m), as well as in surface samples collected by Niskin bottles. Images and metadata were acquired, retrieved from IFCB using the ROI viewer software and the SYKEPIC tool, processed and identified at the Laboratoire d'Océanologie et Géosciences (CNRS UMR 8187 LOG). The discrete dataset corresponds to the 53 stations sampled during the campaign. There are two samples per station to process a total of 10 mL of sampled seawater.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme dune Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant quensemble dun ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 105 enregistrements.

2 tableurs de données dextension existent également. Un enregistrement dextension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre denregistrements dans chaque tableur de données dextension est illustré ci-dessous.

Event (noyau)
105
ExtendedMeasurementOrFact 
7029
Occurrence 
2308

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous naffiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Brasseur S, Szrama V, Chomienne L, Libeau A, Pazalot M, Schmidt I, Levoy O, Artigas L F (2026). Phytoplankton taxonomic diversity addressed by automated imaging (IFCB) in surface waters of the eastern English Channel during the RiOMar SeineMO-2 oceanographic cruise.

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est EcoTaxa. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède lUUID GBIF suivante : 9bd9302e-ab9e-4e74-9a66-3551a9014da1.  EcoTaxa publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec lapprobation du GBIF France.

Mots-clé

Plankton; Imaging; EcoTaxa; Samplingevent

Contacts

Felipe Artigas
  • Fournisseur Des Métadonnées ●
  • Créateur ●
  • Personne De Contact
Laboratoire d'Océanologie et Géosciences (CNRS - ULCO - U Lille) (Wimereux)
FR
Sophie Brasseur
  • Créateur
FR
Luis Chomienne
  • Créateur
FR
Valentine Szrama
  • Créateur
FR

Couverture géographique

See coordinates

Enveloppe géographique Sud Ouest [49,343, -1,182], Nord Est [50,808, 1,568]

Couverture taxonomique

Pas de description disponible

Phylum Bacillariophyta, Ciliophora, Haptophyta
Class Bacillariophyceae, Cryptophyceae, Dinophyceae
Family Gymnodiniaceae, Heterocapsaceae
Genus Actinoptychus, Cerataulina, Chaetoceros, Coscinodiscus, Cylindrotheca, Delphineis, Didinium, Dinophysis, Diploneis, Diplopsalis, Entomoneis, Ephemera, Euglena, Euterpina, Favella, Gymnodinium, Gyrodinium, Heterocapsa, Katodinium, Navicula, Noctiluca, Phaeocystis, Plagiogrammopsis, Pleurosigma, Polykrikos, Prorocentrum, Protoceratium, Protoperidinium, Pseudo-nitzschia, Pyramimonas, Skeletonema, Strombidium, Thalassionema, Thalassiosira, Torodinium, Warnowia
Species Asterionella glacialis, Cerataulina bergonii, Chaetoceros compressus, Chaetoceros curvisetus, Chaetoceros diadema, Chaetoceros didymus, Chaetoceros socialis, Dinophysis norvegica, Dissodinium pseudolunula, Guinardia flaccida, Guinardia striata, Laboea strobila, Lauderia annulata, Leptocylindrus danicus, Leptocylindrus minimus, Mesodinium rubrum, Navicula transitans, Octactis speculum, Paralia sulcata, Phaeocystis globosa, Plagiolemma distortum, Podosira stelligera, Prorocentrum micans, Pseudo-nitzschia delicatissima, Pseudo-nitzschia seriata, Pyrophacus horologium, Rhaphoneis amphiceros, Rhizosolenia imbricata, Rhizosolenia setigera, Scrippsiella acuminata, Strombidium inclinatum, Tetraselmis suecica, Thalassionema nitzschioides, Tiarina fusus, Tripos furca

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2024-07-18 / 2024-07-30

Métadonnées additionnelles

Supporting/Funding projects: - French State – ERDF - Hauts-de-France Region- Project (CPER) - Approche Intégrée des Défis Maritimes et Littoraux (IDÉAL) - 2021-2028 - Priority Research Project “Ocean and Climate” PPR RiOMar (2022-2028) supported by a France 2030 grant (ANR-22-POE-0006) - Priority Research Project “Ocean and Climate” PPR Future OBS (2022-2028) supported by a France 2030 grant (ANR-22-POCE-0004) - operated by the French National Research Agency - Horizons-CL6-2022-BIODIV-01-0 Observing and mapping marine ecosystems - Next Generation Tools - OBAMA - NEXT (2022-2026) - Grant agreement ID: 101081642. - HORIZON-MISS-2022-OCEAN-01-07 - Integration of biodiversity monitoring data into the Digital Twin Ocean - DTO BioFlow (2023-2027) - Grant agreement ID: 101112823. Many thanks to the captain and crew members of the "Côtes de la Manche" Research Vessel (FOF), the PIs, scientists, engineers, technicians and interns participating in the RiOMAR SeineMO-2 cruise. Thanks to Kaisa Kraft from SYKE (FI) for SYKEPIC assistance and to the ECOTAXA support team at LOV for their help. SISMER reference of the RiOMar SeineMO-2 cruise: ARTIGAS Luis Felipe (2024) RIOMAR SeineMO cruise, RV Côtes De La Manche, https://doi.org/10.17600/18003001

Description de la fréquence de mise à jour periodic review of origin data